Время действия — 2261 год (четвертый сезон) — период между исходом Ворлонцев и Теней и началом военных действий против диктатуры Кларка на Земле.
Испытывая сложности со снабжением, вызванные блокадой станции, организованной президентом Кларком, экипаж старается максимально парализовать деятельность космических пиратов. Во время одного из таких рейдов Сьюзен Иванова находит артефакт колоссальных размеров, который буксируется к станции.
Практически сразу на Вавилон-5 прибывает экспедиция ксеноархеологов во главе с доктором Трент.
Только Лита Александер чувствует опасность — в итоге она, будучи бессознательна в телепатическом трансе, запирается в своей каюте и исписывает все стены надписями «Помни об опасности».
Вновь обретенный артефакт оказывается вратами в Третье пространство, обнаруженное более миллиона лет назад ворлонцами. Последние жаждали всемогущества, поэтому стремились освоить неизведанные формы существования пространства. Однако оказалось, что это пространство заселено отнюдь не дружественными существами, поэтому ворота попытались уничтожить, но часть ворлонцев спрятала артефакт в гиперпространстве.
После получения энергии от посылаемых со станции аппаратов артефакт активизировался и открыл путь в нашу вселенную существам из иной реальности. Эти существа оказались очень сильными телепатами и смогли найти на станции существ, которые поддавались их телепатическому воздействию. На станции вспыхнули беспорядки, а в это время из портала появились первые корабли чужаков.
Флоту «Вавилона-5» удалось отбить первую волну нападавших, но стало ясно, что со всем флотом пришельцев им не совладать. Поэтому Шеридан принимает решение доставить на артефакт тактическую термоядерную бомбу, что ему вполне успешно удается.
Во время пребывания внутри артефакта он видит существ из иной реальности — это осьминогоподобные существа с острыми клыками. Однако схватить капитана им не удается. После взрыва артефакта существование станции нормализуется.